众人皆知移花宫宫主邀月（于莉 饰）美若天仙但心狠手辣，但宫女月奴（萧蔷 饰）却偏偏要挑战她的底线。她本以为和江枫（陈俊生 饰）私奔最惨不过是一死，但没想到，她那两个刚刚出生的婴儿却得到了比死亡还要悲惨的将来。邀月抱走了其中的一个取名为花无缺（苏有朋 饰），将另一个留给了江枫的结拜兄弟，名震江湖的大侠燕南天（林瑞阳 饰），她要让这两兄弟在不知情的情况下成为仇人，骨肉相残。燕南天查出义弟之死实为遭人陷害，愤怒的他一路追到恶人谷，却中了恶人们的埋伏武功尽失。恶人们收养了燕南天带来的婴孩，取名小鱼儿（林志颖 饰）。 　　二十年之后，小鱼儿离开恶人谷进入了险恶的江湖，在与温柔可人的铁心兰（陈德容 饰）互生情愫之后又遇见了泼辣的张菁（李绮红 饰），而此时的花无缺也成为了一名武功高强的翩翩美少年，离开移花宫的他目标只有一个，那就是杀掉“仇人”小鱼儿。

故事讲叙二十年前的一场腥风血雨的武林斗争，让令人景仰的风无缺及江飞鱼将成为“武林神话”，二十年后，武林即将再度掀起一场血雨风暴。 江小鱼和风无忌生长在不同的环境，一个是精灵顽皮的赌坊小少，一个是平凡善良的木林樵夫，没想到原本两个毫无关系的人竟在相遇后，抛起多年前的恩怨情仇，历尽多次的共患难，解开种种的疑团，原来两人即是武林神话之后，无缺及飞鱼之子，得知这项令人震惊的消息，两人便更有默契的扛起这场武林的恩怨。二十年前，岳龙轩与双骄之战，改变了武林的历史；二十年后的今日，岳龙轩再次出现，小鱼及无忌一群人即将迎战。

《绝代双骄》是国内首部改编自古龙先生同名小说的动画作品。作品讲述了一对孪生兄弟相爱相杀的命运纠葛：17年前，“天下第一富豪”江枫与其待产妻子遭遇江湖恶盗十二星相的追杀，临死前诞下一对双胞胎。其中，一位被划破脸颊带到恶人谷，另一位则被收入武林禁地移花宫。多年后，刀疤少年江小鱼被恶人谷内五大恶人养大，立志成为“天下第一恶人”；而翩翩公子花无缺，则秉持师父邀月“断情绝欲，除恶卫道”的理念下山除恶。命运的齿轮开始转动，两兄弟迥然不同却又无法割裂的江湖人生就此展开......